Junior César wolnym zawodnikiem

Piłkarz był własnością klubu Flamengo Rio de Janeiro, jednak przez ostatnie póltora roku przebywał na wypożyczeniu w Atlético Mineiro. Jego kontrakt z  zespołem Flamengo skończył się 31 grudnia 2013 roku, a zawodnik negocjował przez ostatnie trzy tygodnie podpisanie umowy z Atlético. Negocjacje zakończyły się fiaskiem i Junior César jest obecnie bezrobotny.

31-letni lewoskrzydłowy przez ostatnie miesiące przegrywał rywalizację o miejsce w składzie z Ricardinho, czasami ustępował też miejsce młodemu Lucasowi Cândido. Podczas ostatnich Klubowych Mistrzostw Świata Junior César nie wyszedł ani razu na boisko.

Podczas pobytu w Atlético Mineiro César zdobył z ekipą "Galo" Copa Libertadores, mistrzostwo stanu Mineiro i był wicemistrzem Brazylii.