Portugalczyk jest trenerem „Nietoperzy” od 4. lipca 2014. Zastąpił na stanowisku Juana Antonio Pizziego, podpisując roczny kontrakt. Szybko przekonał do siebie piłkarzy, kibiców i zarząd, czego efektem jest nowa, trzyipółroczna umowa.
W obecnym sezonie Valencia zajmuje 5. miejsce w tabeli Primera Division, ledwie punkt za 4. Sevillą i trzy za 3. Atletico. W ostatnim meczu ligowym z Celtą Vigo, zespół wydłużył swoją serię meczów bez porażki do ośmiu. Ostatni raz podopieczni Nuno zaznali goryczy porażki 30. listopada, kiedy na Estiadio Mestalla gościła Barcelona.