Doświadczony środkowy obrońca dołączył do klubu z Podlasia na zasadzie wolnego transferu po tym, jak wygasła jego umowa z Lechią Gdańsk.
32-letni zawodnik zaliczył obligatoryjne testy medyczne i następnie związał się z nowym pracodawcą kontraktem obowiązującym do połowy 2022 roku. W zawartym porozumieniu pomiędzy piłkarzem a zespołem znalazł się także zapis umożliwiający przedłużenie jego pobytu w Jagiellonii o kolejne dwanaście miesięcy.
Błażej Augustyn występował w „Biało-Zielonych” od sezonu 2016/2017. Od tego czasu rozegrał 64 spotkania dla ekipy z północy kraju, w których strzelił pięć goli i zaliczył jedną asystę oraz przyczynił się do wywalczenia Pucharu (2018/2019) i Superpucharu Polski (2019) przez zespół z województwa pomorskiego.
Były gracz między innymi Legii Warszawa, Catanii, Górnika Zabrze, Hearts czy Ascoli jest pierwszym letnim wzmocnieniem drużyny z Białegostoku.