W FC Porto rozegrał trzy pełne sezony. W tym na murawie pojawił się 15 razy, do siatki rywali trafiając 2 razy.
- Freddy jest graczem, którego potrzebowaliśmy. Cechuje go jakość,charyzma,siła fizyczna i to, że bierze na siebie odpowiedzialność za grę zespołu. Teraz potrzebuje czasu, by powrócić do wysokiej formy. Chcemy, by szybko zaadoptował się do włoskiej piłki. - mówił Claudio Ranieri.
25-latek dołączył do Porto w 2008 roku z Saint-Etienne, gdzie spędził dwa sezony. Zaledwie kilka dni po odejściu z klubu Victora Pereiry.
- Jestem szczęśliwy z możliwości gry w Interze. Teraz muszę odpocząć po podróży - powiedział po przybyciu do Mediolanu.
Guarin największe sukcesy odnosił za kadencji Andre Villas-Boasa, gdy wraz z zespołem sięgnął po potrójną koronę. FC Porto było najlepsze w Lidze, Lidze Eurropy i Pucharze Portugalii.