Adrian Małachowski jest wychowankiem Zawiszy Bydgoszcz, a w swojej karierze był też związany między innymi z Legią Warszawa czy GKS-em Bełchatów.
W sierpniu 2020 roku postanowił jednak przenieść się do Niemiec, a tam zgłosił się po niego przedstawiciele trzeciej ligi niemieckiej, czyli 1. FC Magdeburg.
O ile w pierwszym sezonie, kiedy tylko był zdrowy, grał, o tyle w tym kończącym się otrzymywał szanse już zdecydowanie rzadziej.
Jego zespół wywalczył awans na zaplecze Bundesligi i w oficjalnym komunikacie poinformował, że nie decyduje się na kontynuowanie współpracy z 24-letnim defensywnym pomocnikiem.
Wraz z końcem sezonu stanie się on wolnym zawodnikiem. Na ten moment nie wiadomo, gdzie trafi.
Od początku swojego pobytu w Niemczech Małachowski rozegrał łącznie 44 mecze, a jego dorobek to trzy asysty.