Były obrońca Barcelony swoją karierę piłkarską zakończył w 2012 roku właśnie w argentyńskim klubie, zaraz potem obejmując tam rolę trenera zespołu juniorów. Na skutek nieporozumień z prezesem Hugo Moyano dość szybko pożegnał się z posadą. Potem zaliczył też, tym razem jako pierwszy szkoleniowiec, epizod w Estudiantes. Z końcem ubiegłego roku opuścił także to stanowisko.
Teraz 35-letni Milito wraca do Independiente, zastępując Mauricio Pellegrino. Co ciekawe, podobna zmiana miała też miejsce, gdy były stoper obejmował Estudiantes.
Europejskim kibicom Argentyńczyk kojarzy się przede wszystkim z występami dla Barcelony, którą reprezentował w latach 2007-2011. Tam dwa razy sięgał m.in. po Ligę Mistrzów oraz trzykrotnie po mistrzostwo Hiszpanii.