Reprezentant Gabonu został zawodnikiem "Żółto-Czarnych" latem 2013 roku. Jego poprzedni klub, AS Saint-Étienne otrzymał za niego 13 milionów euro. 26-latek związał się z Borussią pięcioletnią umową.
W minionym sezonie "Auba" był najlepszym zawodnikiem drużyny prowadzonej przez Jürgena Kloppa. Dzięki ustawieniu go pozycji środkowego napastnika Borussii udało się przełamać kryzys i wyjść ze strefy spadkowej. Przez dwa lata pobytu w BVB Gabończyk wystąpił w 95 spotkaniach, w których zdobył 41 goli i zaliczył 16 asyst.
Nowa umowa Aubameyanga będzie obowiązywać do 30 czerwca 2020 roku. W ostatnim czasie pojawiło się wiele spekulacji na temat jego przyszłości; zainteresowanie nim ponoć wyrażał Arsenal.
- Jestem bardzo zadowolony z faktu, że na kilka najbliższych lat związałem moją sportową przyszłość z Borussią Dortmund. Czuję się bardzo dobrze w tym klubie, jak i w samym mieście. BVB stała się dla mnie drugim domem. Jestem związany z nią całym sercem i nie chciałem się stąd ruszać - powiedział napastnik.