25-latek od lutego zmagał się z kontuzją ścięgna Achillesa, która uniemożliwiła mu pełny udział w przedsezonowych przygotowaniach drużyny mistrza Niemiec. Na początku października zawodnikowi udało się powrócić do zdrowia, lecz hiszpański szkoleniowiec nakazał mu przejść do zespołu rezerw, który występuje w Regionallidze Bawarii (czwarty poziom rozgrywkowy).
Kirchhoff trafił do Bayernu latem 2013 roku. O jego transfer z FSV Mainz zabiegało kilka klubów z Bundesligi. Po pół roku występów w drużynie z Allianz Arena został on wypożyczony do Schalke, gdzie spędził osiemnaście miesięcy. To właśnie podczas gry w "Königsblauen" nabawił się poważnego urazu.
Do czasu otwarcia zimowego okna transferowego stoper będzie występował w zespole rezerw. Wtedy też podjęta zostanie decyzja co do jego dalszej przyszłości w Bayernie.