28-letni Reyes jest wychowankiem Sevilli, zadebiutował w tym klubie mając zaledwie 16 lat. Szybko stał się podstawowym graczem drużyny i rozchwytywanym zawodnikiem w Europie. Od 2004 roku grał w Arsenalu, Realu Madryt, Atletico i Benfice Lizbona.
Od 2007 roku był zawodnikiem klubu z Vicente Calderon. Po odejściu trenera Gregorio Manzano i zatrudnieniu Diego Simeone Reyes był łączony z transferem do Galatasaray, jednak wyznał, że pragnie wrócić do klubu, w którym rozpoczynał piłkarską karierę.
Oficjalnie: Reyes wraca do Sevilli
Sevilla potwierdziła na swojej stronie internetowej, że zawodnik Atletico Madryt, Jose Antonio Reyes, wraca do klubu po ponad siedmiu latach. Kontrakt został podpisany na trzy i pół roku.