Ljuboja ma bardzo bogatą karierę i występował dotychczas głównie w Ligue 1 i Bundeslidze. Serb już jako junior trafił do Sochaux, w którym zadebiutował w piłce seniorskiej. Później zagrał jeszcze w Strasbourgu, PSG, VfB Stuttgart, Hamburger SV, Wolfsburgu, Nicei, Grenoble i ostatnio Legii Warszawa.
„Borsuk” w ciągu dwóch lat w polskiej T-Mobile Ekstraklasie zdobył 23 gole. W ciągu całej kariery na francuskich boiskach, do siatki rywali trafiał 76 razy. Teraz będzie miał okazję podreperować swój bilans.
Danijel Ljuboja zadebiutował w reprezentacji Jugosławii 2003 roku, później zagrał 16 spotkań dla Serbii i Czarnogóry a na koniec dwukrotnie dla Serbii.