Rozpoznawalny i niezwykle ceniony zawodnik we Francji rozwiązał za porozumieniem stron umowę z AS Saint-Étienne tuż po rozpoczęciu zimowego okna transferowego. W zaistniałej sytuacji należało przypuszczać, że doświadczony bramkarz znajdzie bardzo szybko chętnego na swoje usługi, mimo że po raz ostatni wybiegł na boisko w lutym ubiegłego roku.
Wówczas popadł on w konflikt z Claude'em Puelem, który nie miał żadnych skrupułów związanych z odstawieniem legendy „Zielonych” od składu.
Stéphane Ruffier nie potrafił długo pogodzić się z takim obrotem spraw, ale dopiero na początku tego roku wykonał najboleśniejszy dla siebie krok związany z zakończeniem blisko 10-letniego pobytu w Saint-Étienne.
Trzykrotny reprezentant Francji nie poprzestał na podjęciu tej decyzji i po kilkunastu dniach ogłosił, że kończy definitywnie swoją przygodę z futbolem i wraca do rodzimego Aviron Bayonnais, gdzie będzie nadzorował pracę klubowej akademii oraz odpowiadał za szkolenie bramkarzy.
Ekipa ze Stade Didier Deschamps rywalizuje obecnie w Championnat National 3 (piąta klasa rozgrywkowa), gdzie do momentu zawieszenia rozgrywek przez pandemię koronawirusa plasowali się w strefie spadkowej z dorobkiem trzech wywalczonych punktów po trzech rozegranych meczach.
Ruffier w trakcie swojej 16-letniej kariery wywalczył tylko jedno trofeum - Puchar Ligi Francuskiej w sezonie 2012/2013 z „Zielonymi”. Poza nimi występował jeszcze w AS Monaco.
W obu tych klubach rozegrał łącznie 516 spotkań z czego 383 w Saint-Étienne, co pozwoliło pobić mu bramkarski rekord występów Ivana Ćurkovicia (303).
Ponadto razem z reprezentacją „Trójkolorowych” pojechał na Mistrzostwa Świata w 2014 roku, gdzie pełnił funkcję zmiennika Hugo Llorisa.