42-latek rozpoczął swoją karierę trenerską w 2001 roku, kiedy to objął Kaszubię Kościerzyna. W 2006 roku przeniósł się do Lechii Gdańsk, w której przez pierwsze trzy lata pełnił funkcję asystenta. W 2009 został pierwszym szkoleniowcem "Biało-Zielonych". 8 listopada 2011 pożegnał się ze stanowiskiem. Później pracował w Cracovii, Flocie Świnoujście, Olimpii Grudziądz i ponownie w Flocie. W 2015 roku zastąpił Pawła Janasa w roli trenera Bytovii Bytów. 18 marca tego roku zwolniono go z pełnionej funkcji.
- Szybko doszliśmy do porozumienia. Klubowi działacze przedstawili mi jasną i klarowną sytuację oraz dobry plan na przyszłość. Cieszę się, że mi zaufano i że mogę pracować w Górniku. Po cichu liczyłem na taką propozycję - stwierdził nowy trener "Zielono-Czarnych".
Pierwszym nieoficjalnym meczem Kafarskiego w nowej roli będzie jutrzejszy sparing z Motorem Lubin. Według informacji "Kuriera Lubelskiego" ofertę pracy w Górniku dostali Robert Podoliński (ostatnio Radomiak Radom) i były asystent Franciszka Smudy - Marcin Broniszewski.